柯南的剧场版第四部《瞳中的暗杀者》二○○○年四月17日在日本上映
　　这部我认为是已排的四部中最具悬念的一部，剧中小兰身处案发现场，由于种种原因而失忆了。但是因為连续殺人犯在开枪時，被小蘭看到了他的模樣，而小兰即遭到了随时被狙击的命運！同时这件杀人案又有可能牵连警察内部，平时值得信任的刑警也被当作了嫌犯。为了唤起小兰的记忆最好的方法就是让他见到新一，但是……柯南又要如何化解這次的危机！究竟犯人是誰？會是普通小娄娄，或是為居高階級的警察官！？柯南即將面临史上又一次最大危机！！这次的高潮部分发生在新一变小的那个游乐场，这次柯南又要一显他特工般的划板工夫了……

主要内容
　　一个雨天柯南刚和小兰打晚电话，在回家的路上遇到了步美他们。众人在马路旁看到一个很象刑警的人，可谁知刚走过马路，就看到这位刑警被人枪杀。大家都没看清杀手的样子，唯一了解的是，凶手是个左撇子。几天后，又一名刑警死在一幢大楼的停车场，手上握着一本警用手册。
　　几天后,在白鸟警官妹妹的订婚PARTY上,毛利一家人及众多警官纷纷到场，连刑事科局长也到了,PARTY上当毛利问起两起凶案时，白鸟对他说:"Need not know."这是警界的隐语，意思是该案与警界人士有关。不久突然停电，在洗手间的小兰和佐藤,摸索间小兰发现并拿出了放在暗处的手电，枪声响起，佐藤中枪，小兰失去知觉。
　　众刑警立刻调查，可在大楼里没有一人身上发现有硝烟反应，而小兰却失忆了。终于木暮说出了原委，原来在一年前的一个凶案中，由于案件与刑事局长儿子有关而未有深查。此案被断为自杀，而被害者的妹妹及一名因此案牺牲的警官的儿子却一直对此事耿耿于怀。最近警方又派当时的几名警官重查此案，但调查的三个人却接连遭袭。
　　柯南记起当天在PARTY确实有几个可疑人物，并推测小兰可能看到了凶手的样子。不久失忆的小兰出了院。虽然警方已派人日夜保护，但小兰还是差点被火车撞到，多亏了柯南才捡回一命。为了保护小兰，柯南开始调查，在与几位当事人接触后，柯南发现了一连串线索，并揭开了无硝烟反应的开枪方法。
　　同时小兰记起曾经去过的热带乐园，为了不让柯南担心，小兰与小五郎等人偷偷的去了游乐园。在那里少年侦探团制服了一个可疑人物，但真正的凶犯还未出现。晚上，小兰遭到凶手的狙击，而此时柯南还在赶往游乐园的路上。不久两人相遇，在与凶手20分钟的周旋后，凶手终于在柯南的超强球鞋及小兰的空手道的连击下被捕了，小兰恢复了记忆，佐藤警官也恢复了清醒。

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